Unicell - Protocoles standard

La génomique/transcriptomique à partir de cellule unique intègre plusieurs étapes dont la collecte appropriée et la préservation des échantillons environnementaux, la séparation physique des cellules d’intérêt à partir de communautés plus ou moins complexes et la lyse cellulaire suivie de l’amplification du génome ou de transcriptome en vue du séquençage.

En plus de cellules microbiennes de procaryotes et d’eucaryotes, UNICELL peut prendre en charge le tri de consortiums microbiens (p. ex. symbioses), des virus ou de cellules infectées par des virus.

Actuellement en phase de développement, UNICELL propose un certain nombre de protocoles standard 'd’omique' à partir de cellules individuelles maîtrisés dans la plateforme et fourni également des conseils en développement méthodologique. Pour tout développement méthodologique sur l’analyse et le tri des cellules à partir des échantillons complexes, merci de nous contacter.

Exemples d’activités menés par la plateforme :

• Analyse et tri de cellules planctoniques à partir d’eau douce, eau de mer et enrichissements en culture
• Tri par autofluorescence naturelle : ex. Chlorophylle, Phycoérythrine, Bactériochlorophylle, F420
• Tri par fluorescence induite par colorants des acides nucléiques, compartiments cellulaires
• Micromanipulation de cellules de protistes
• Lyse cellulaire et amplification génomique par la technique WGA (Whole Genome Amplification)
• Formation à l’acquisition, à l’analyse et à l’interprétation des résultats obtenus
• Conseils aux utilisateurs