Diversity, Ecology and Evolution of Microbes
Equipe DEEM

Notre équipe s’intéresse à différents aspects de l’écologie et de l’évolution des microorganismes, de l’origine de la diversité microbienne et son évolution depuis l’origine de la vie sur Terre au rôle des communautés microbiennes dans les cycles biogéochimiques. Nous combinons des approches complémentaires tels l’exploration de la diversité environnementale des lignées procaryotes et eucaryotes à travers des approches de type métabarcoding, métagénomiques, « single-cell » et phylogénomiques pour inférer le potentiel fonctionnel et pour élucider l’histoire évolutive des différentes lignées microbiennes. Nous nous intéressons aussi à des questions interdisciplinaires, notamment à l’interface biologie-géologie.

L’équipe DEEM, fondée initialement par Puri Lopez-Garcia et David Moreira, est l’une des sept composantes de l’unité d’Ecologie, Systématique et Evolution (UMR 8079, CNRS – Université Paris-Sud – AgroParisTech).

Dernières parutions

Les archées représentent jusqu'au 99% des microorganismes des communautés des lacs hypersalés et influencés par le géothermalisme dans la Dépression du Danakil, Ethiopie

Découverte d'un nouveau phylum fongique, les Sanchytriomycota, par notre ancien thésard Luis Galindo, en collaboration avec Sergey Karpov

Vampirococcus lugosii, la bactérie vampire dévoilée à Nature Comms. Avec quelques curiosités historiques

Jolien et Laura ont contributé à une étude sur l'origine du conoïde chez les apicomplexes (PLoS Biol)

Missions de terrain

Septembre 2021 - Islande: échantillonnage de diverses sources termales entre volcans et glaciers

Décembre 2019 - Salar de Huasco, Chili: Accompagnés par Cristina Dorador et son équipe, nous avons échantillonné des tapis microbiens et des sédiments le long d'un gradient de salinité dans le Salar de Huasco à 3800 m de hauteur.

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Contact

Adresse : Equipe DEEM Unité d’Ecologie, Systématique et Evolution Rue Doyen André Guinier, bâtiment 360, 91400 Orsay, France Tél.: +33 (0)1 69 15 76 08