Diversity, Ecology and Evolution of Microbes
Equipe DEEM

Notre équipe s’intéresse à différents aspects de l’écologie et de l’évolution des microorganismes, de l’origine de la diversité microbienne et son évolution depuis l’origine de la vie sur Terre au rôle des communautés microbiennes dans les cycles biogéochimiques. Nous combinons des approches complémentaires tels l’exploration de la diversité environnementale des lignées procaryotes et eucaryotes à travers des approches de type métabarcoding, métagénomiques, « single-cell » et phylogénomiques pour inférer le potentiel fonctionnel et pour élucider l’histoire évolutive des différentes lignées microbiennes. Nous nous intéressons aussi à des questions interdisciplinaires, notamment à l’interface biologie-géologie.

L’équipe DEEM, fondée initialement par Puri Lopez-Garcia et David Moreira, est l’une des sept composantes de l’unité d’Ecologie, Systématique et Evolution (UMR 8079, CNRS – Université Paris-Sud – AgroParisTech).

Dernières parutions

Crystal Ball: Physical connections: prokaryotes parasitizing their kin, des perspectives sur des symbioses intimes entre procaryotes, by Puri and David (Environ Microbiol Rep)

Des communautés microbiennes partagées dans des microbialites échantillonnés le long d'un gradient d'alcalinité, par Miguel Iniesto et al. (Environ Microbiol)

Lithoflexus mexicanus, un nouveau membre photosynthétique des Chloroflexi associé à des microbiales avec une structure verticale quasi-clonale, par Aurélien Saghaï et al. (Genome Biol Evol 2020)

Puri et David reviennent sur l'hypothèse syntrophique sur l'origine des eucaryotes (Nature Microbiology 2020)

Missions de terrain

Décembre 2019 - Salar de Huasco, Chili: Accompagnés par Cristina Dorador et son équipe, nous avons échantillonné des tapis microbiens et des sédiments le long d'un gradient de salinité dans le Salar de Huasco à 3800 m de hauteur.

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Adresse : Equipe DEEM Unité d’Ecologie, Systématique et Evolution Rue Doyen André Guinier, bâtiment 360, 91400 Orsay, France Tél.: +33 (0)1 69 15 76 08