Diversity, Ecology and Evolution of Microbes
Team
Purificación López-García
Directora de Investigación, CNRS

Soy bióloga y me interesan las grandes cuestiones evolutivas sobre el origen y la diversificación de la vida, con una atención particular a los linajes microbianos que ocupan la mayor parte de la diversidad biológica.

puri.lopez@cnrs.fr

puri.lopez@universite-paris-saclay.fr

David Moreira
Director de Investigación, CNRS

Hace muchos años, tuve la suerte de recuperar un viejo microscopio que me permitió descubrir un mundo lleno de organismos sorprendentes. Desde entonces me ha interesado la diversidad y evolución de los microorganismos de los tres dominios de la Vida, intentando reconstruir su filogenia y comprender cómo evolucionan sus genomas. Recientemente me he interesado en la relación evolutiva entre organismos vivos (células) y no-vivos (virus).

david.moreira@universite-paris-saclay.fr

Ludwig Jardiller
Profesor, Université Paris-Saclay

Soy un ecologo microbiano. Mis actividades de investigación tienen por objeto comprender mejor la diversidad microbiana, los procesos que la estructuran y el papel que desempeñan los microorganismos en el funcionamiento de los ecosistemas acuáticos. saber más…

Email: ludwig.jardillier@universite-paris-saclay.fr

Teléfono: 0033 169 157 989

Laura Eme
Directora de Investigación, CNRS

laura.eme@cnrs.fr

laura.eme@universite-paris-saclay.fr

Yvan Zivanovic
Investigador CNRS

yvan.zivanovic@cnrs.fr yvan.zivanovic@universite-paris-saclay.fr

Philippe Deschamps
Investigador, CNRS

philippe.deschamps@cnrs.fr

philippe.deschamps@universite-paris-saclay.fr

Miguel Iniesto
Profesor asociado, U. Paris-Saclay

Mi interés por la investigación y la docencia comenzó durante mi licenciatura en Biología. Después de un máster en Microbiología Clínica, me uní al laboratorio de Ecología Microbiana (Departamento de Ecología) como estudiante de doctorado bajo la supervisión de las profesoras María del Carmen Guerrero y Ana Isabel López-Archilla. Mi tesis doctoral, titulada "Microbial Mats: the implication of these microbial communities in the early stages of fossilization", en colaboración con el grupo de Paleontología dirigido por las profesoras Angela D. Buscalioni y Karim Benzerara (IMPMC, Sorbonne Université), me permitió adentrarme en un tema complejo (la formación de fósiles mediada por microorganismos) con un enfoque altamente multidisciplinar (combinando ecología, microbiología, paleontología, geología, mineralogía y estadística) y obtener resultados con un impacto significativo en la comunidad científica.

Posteriormente, me uní al equipo de Arnaud Brayard como parte de su proyecto "After the end: the rebuilding marine communities during the Rediversification of the Lower Triassic" [AFTER]. Durante este primer posdoctorado en el laboratorio de Biogéosciences de la Université de Dijon, estudié la formación de fósiles del yacimiento excepcional del "Paris Biota" (Triásico, EE. UU.).

Después de Dijon, me trasladé a París y me uní al equipo Diversity, Ecology and Evolution of Microbes (DEEM) bajo la supervisión de Purificación López-García para estudiar la formación de microbialitas. La bioinformática, la ecología microbiana y la mineralogía nos ayudaron a desvelar los factores (abióticos y biológicos) que determinan la generación de estas estructuras organosedimentarias. Las microbialitas están ahora muy en boga porque tienen un vínculo directo con dos temas de gran impacto. En primer lugar, son las primeras evidencias de vida en la Tierra. Los estromatolitos (un tipo de microbialita) han sido aceptados como las primeras comunidades vivas en la Tierra primitiva, y existe un gran debate sobre el origen biológico o no de algunas estructuras de hace 3.500 millones de años. Conocer los mecanismos que explican la formación de estas estructuras es fundamental para resolver este debate y tendría un impacto directo en la búsqueda de rastros de vida en Marte. Además, estas comunidades suelen mineralizarse en carbonatos, por lo que pueden actuar como reservorios de carbono. Una comprensión real de los procesos de mineralización en las microbialitas podría ayudarnos a aumentar y estimular la captación de CO2 por parte de estas comunidades y tratar de minimizar el impacto del cambio global a escala mundial. Además, también colaboro en la caracterización de la diversidad microbiana de diversos entornos desconocidos, principalmente mediante enfoques de metabarcoding, y también colaboro como experto en estadística con el Dr. Villar-Quiles, neurólogo del hospital Pitié-Salpêtrière - Sorbonne Université.

En lo que respecta a mi actividad docente, participo en clases a todos los niveles (licenciatura, licenciatura profesional y máster) en asignaturas relacionadas con la ecología, la biología molecular y la microbiología:

  • L2Pro - UE4 Bio-production - Microbiologie - Virologie (Responsable de asignatura)
  • L3Pro - Formation en Apprentissage/en Stage
  • L3Pro - Exploration des Environnements Pro
  • L3Pro - Génie Génétique

  • L2BIO - Anglais scientifique

  • L2BIO - Milieux Aquatiques
  • L3BOE - Écologie : théorie et pratique

  • Master BEE - Mise à niveau en écologie aquatique

  • Master BEE - Milieux aquatiques : qualité et gestion
  • Master BEE - Méthodologie et Ecologie
  • Master BioSanté - Evolution et biodiversité des microorganismes
Maria Ciobanu
Ingeniero de investigación, CNRS

maria-cristina.ciobanu-costache@cnrs.fr maria.ciobanu@universite-paris-saclay.fr

Tel. +33 (0)1 69 16 63 42

Paola Bertolino
Asistente técnico, CNRS

paola.bertolino@cnrs.fr

paola.bertolino@universite-paris-saclay.fr

Jelena Jaric
Asistente técnico

jelena.jaric@universite-paris-saclay.fr

Julie Montagna
Asistente SYMBEK

julie.montagna@universite-paris-saclay.fr

Carmen Miravete
Asistente bioinformático SYMBEK

carmen.miravete@universite-paris-saclay.fr

Ana Gutiérrez-Preciado
Postdoc

ana.gutierrez@universite-paris-saclay.fr

Kristina Prokina
Postdoc

kristina.prokina@universite-paris-saclay.fr

Bledina Dede
Postdoc

bledina.dede@universite-paris-saclay.fr

Jazmin Blaz
Postdoc (Doctoranda 2020-2023)

jazmin-itzel.blaz-sanchez@u-psud.fr

Paul Roginski
Postdoc

paul.roginski@universite-paris-saclay.fr

Lewen Liang
Postdoc

lewen.liang@universite-paris-saclay.fr

Jeanne Caumartin
Postdoc (Doctoranda 2021-2024)

jeanne.caumartin@sorbonne-universite.fr

Romain Leroy
Doctorando

romain.leroy@universite-paris-saclay.fr

Arthur Szylit
Doctorando

arthur.szylit@univ-littoral.fr

Agathe Struillou
Doctoranda

agathe.struillou@universite-paris-saclay.fr

Luna Marin
Doctoranda

Estudiante en tesis

Zoe Commander
Doctoranda

zoe.commander@inrae.fr

Pedro Romero
Doctorando

pedro.romero@universite-paris-saclay.fr

Stagiaires
Visitantes y estudiantes

2023-2024 Zoé Commander (M2), Agathe Brédel (M2), Pénélope Degardin (M2), Zachary Galvani (M1)

2022-2023 Marina Grilo (M2), Agathe Struillo (M2)

2021-2022 Romain Leroy (M2), Juliette Thiébaut (M2)

2020-2021 Pierrick Lenormand (M2), Guillaume Peugnet (M1), Anouk Cohen-Solal (L1), Yannis Arab (L2), Alix Catry (M1 INSA), Chloé Barthalon (L3)

2019-2020 Jeanne Chaumont, David Boulesteix (M2), Dave Edison Rojas (M2 Erasmus), Iris Rizos (M1)


Former members
Pablo Aguilar
Profesor invitado 2024

pablo.aguilar@uantof.cl

Anabel López-Archilla
Profesora invitada 2023

Anabel es una collboradora de la Universidad Autónoma de Madrid (UAM).

Sergey Karpov
Invited prof., St Petersburg University

Sergey es un colaborador que ha realizado varias estancias entre los años 2015-2018 en nuestro laboratorio.

sakarpov4@gmail.com

Carolina Cubillos
Postdoc 2021 - 2024

Postdoc

Electra Kotopoulou
Postdoc 2021-2023

Postdoc electra.kotopoulou@universite-paris-saclay

Guillaume Louvel
Postdoc 2021-2023

guillaume.louvel@universite-paris-saclay.fr

Lukas Novak
Postdoc 2021-2023

lukas.novak@u-psud.fr

Jolien van Hooff
Postdoc 2019-2022

jolien.van-hooff@u-psud.fr

Sergio Muñoz
Postdoc 2020-2022

Mi investigación se centra en el studio de la naturaleza del ancestro mitocondrial y la evolución temprana de la mitocondria y los eucariotas. Actualmente estoy analizando metagenomas de distintos ambientes poco explorados en busca de nuevas Alphaproteobacteria. También trabajo en la reconstrucción de filogenias robustas y libres de artefactos para las Alphaproteobacteria y mitocondrias.

sergio.munoz@universite-paris-saclay.fr

Julien Massoni
Postdoc 2020-2022

julien.massoni@u-psud.fr

Luis J. Galindo
Tesis 2017-2020, postdoc 2020-2021

luis-javier.galindo-gonzalez@u-psud.fr

Guifré Torruella
Postdoc 2015-2020

guifré.torruella@u-psud.fr

Naoji Yubuki
Postdoc 2018-2021

naoji.yubuki@u-psud.fr

Brittany Baker
PhD student 2020-2024

brittany.baker@universite-paris-saclay.fr

Feriel Bouderka
Doctoranda 2020-2024

feriel.bouderka@universite-paris-saclay.fr

Fabian van Beveren
Doctorando 2018-2022

fabian.van-beveren@u-psud.fr

Thomas Bacchetta
Doctorando 2018-2022

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Gwendoline David
Doctoranda 2017-2020

gwendoline.david@u-psud.fr

Jodie Belilla
Doctoranda 2017-2020

jodie.belilla@u-psud.fr

Guillaume Reboul
Doctorando 2017-2020

guillaume.reboul@u-psud.fr

Solenne Irion
PhD student 2017-2019

solene.irion@univ-littoral.fr

Other PhD students and postdocs
Antiguos doctorandos y postdocs

PhD students

Marie Ragon (2007-2011), Estelle Couradeau (2008-2012), Charles Bachy (2008-2012), Jonathan Lombard (2009-2012), Céline Petitjean (2009-2013), Marianne Simon (2010-2014), Aurélien Saghaï (2013-2016), Rafael Ponce-Toledo (2014-2018), Jodie Belilla (2017-2020), Guillaume Reboul (2017-2020), Gwendoline David (2017-2020), Luis Javier Galindo (2017-2020), Solène Irion (2017-2020)

Postdocs

Emmanuelle Gérard (2003-2005), Jan Slapeta (2003-2005), Enrique Lara (2007-2008), Ana Belén Martin-Cuadrado (2007), Achim Quaiser (2007-2008), William Marande (2008-2009), Philippe Deschamps (2009-2010), Marie Ragon (2011-2012), Giselle Walker (2014-2015), Kamil Szafranski (2015-2017), Romain Derelle (2015-2016), Magdalena Ruiz (2016-2017), Albert Reñé (2017), Hélène Timpano (2016-2018), Guifré Torruella (2016-2021)