Diversity, Ecology and Evolution of Microbes
Equipe DEEM

Notre équipe s’intéresse à différents aspects de l’écologie et de l’évolution des microorganismes, de l’origine de la diversité microbienne et son évolution depuis l’origine de la vie sur Terre au rôle des communautés microbiennes dans les cycles biogéochimiques. Nous combinons des approches complémentaires tels l’exploration de la diversité environnementale des lignées procaryotes et eucaryotes à travers des approches de type métabarcoding, métagénomiques, « single-cell » et phylogénomiques pour inférer le potentiel fonctionnel et pour élucider l’histoire évolutive des différentes lignées microbiennes. Nous nous intéressons aussi à des questions interdisciplinaires, notamment à l’interface biologie-géologie.

L’équipe DEEM, fondée initialement par Puri Lopez-Garcia et David Moreira, est l’une des sept composantes de l’unité d’Ecologie, Systématique et Evolution (UMR 8079, CNRS – Université Paris-Saclay – AgroParisTech), maintenant sur le site IDEEV (Gif-sur-Yvette).

Dernières parutions

Elles l'aiment salé : les adaptations multiples des archées aux écosystèmes hypersalés

Interactions au sein des communautés microbiennes du Salar de Huasco, un écosystème extrême dans les Andes

A la recherche de la lignée d'archées Asgard plus apparentée aux eucaryotes

Une nouvelle espèce de cyanobactérie thermophile de l'ordre Gloeomargaritales, proche parent des plastes

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Si vous êtes un étudiant motivé ou un jeune postdoc intéressé par nos activités de recherche et avec envie de développer un projet de recherché originale, n’hésitez pas à nous contacter pour un stage, une possibilité de financement ou pour préparer un projet pour une demande de bourse.


Offres en cours

Offre de postdoc sur la phylogénie et la génomique évolutive des archées

Offre de thèse doctorale interdisciplinaire - analyse multiéchelle des microbialites de l'Altiplano des Andes

Missions de terrain

Mars 2023 - Nord du Chili : Une nouvelle expédition aux beaux mais menacés salars et sources chaudes de l'altiplano (~4 000 m), Region d'Atacama

Aout 2022 - Nord du Canada : Echantillonnage de lacs thermokarstiques dans le pergélisol pour étudier les flux de gaz à effet de serre liés à l'activité microbienne.

Mars 2022 - Nord du Chili : Pendant plusieurs semaines, nous avons échantillonné des salars (« salares ») et des sources chaudes de haute altitude dans le nord de l'Altiplano chilien, Region d'Antofagasta.

Septembre 2021 - Islande : Echantillonnage de diverses sources thermales entre volcans et glaciers.

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Adresse : Equipe DEEM

Unité d’Ecologie, Systématique et Evolution

Site IDEEV

12 rue 128, 91190 Gif-sur-Yvette, France

Tél.: +33 (0)1 69 15 76 08