Diversity, Ecology and Evolution of Microbes
En nuestro equipo, nos interesan las grandes cuestiones sobre la ecología y la evolución de la vida microbiana, desde el origen mismo de la diversidad microbiana y su evolución a partir del origen de la vida sobre la Tierra hasta el papel de las comunidades microbianas en los ciclos biogeoquímicos. Para estudiar estos aspectos, combinamos estrategias complementarias que incluyen la exploración de la diversidad procariota y eucariota actual a través de análisis de tipo ‘metabarcoding’, metagénomicos, de genómica de células individuales y de filogenómica con el fin de inferir funciones microbianas y elucidar el orden de emergencia de los diferentes linajes microbianos y su historia evolutiva temprana. También nos interesan temas de naturaleza interdisciplinar, especialmente en la interfase biología-geología.
El equipo DEEM, inicialmente co-fundado por Puri Lopez-Garcia y David Moreira, es uno de los siete componentes de investigación en la unidad de Ecología, Sistemática y Evolución (UMR 8079, CNRS – Université Paris-Saclay – AgroParisTech), ahora en el sitio IDEEV (Gif-sur-Yvette, Francia).
Inferencias de la proporción virus:microorganismo a partir de metagenomas de ecosistemas diversos sugieren que los virus de DNA tienen abundancias comparables, a nivel de orden de magnitud, a las de células
Nuevas especies y géneros de flagelados apusomonádidos enriquecen el árbol filogenético de los eucariotas
Nuevos datos confirman la relación entre afélidos y hongos y apoyan la división de los Holomycota en dos grandes grupos: Phytophagea (afélidos+hongos) y Opisthophagea (rozéllidos+microsporidios).
Las secuencias de los genomas mitocondriales y plastidiales de 25 algas rojas revelan varias expansiones de tamaño independientes debidas a la proliferación de intrones.
¿Por qué no detectamos vida en las salmueras hipersalinas e hiperácidas de Dallol a pesar de un alto nivel de contaminación por el aire? La razón es la destrucción sorprendentemente rápida de células y ADN por estas salmueras.
Marzo 2022 - Norte de Chile: Una nueva expedición a los hermosos y amenazados salares y fuentes termales del altiplano (~4000 m) en la Región de Atacama.
Agosto 2022 - Norte de Canadá: Muestreo de lagos termokársticos en el permafrost para estudiar los flujos de gases de efecto invernadero relacionados con la actividad microbiana.
Marzo 2022 - Norte de Chile: Durante varias semanas hemos muestreado salares y fuentes termales en el norte del altiplano chileno (Región de Antofagasta).
Septiembre 2021 - Islandia: Muestreo en diversas fuentes termales de la isla, entre volcanes y glaciares.
Si eres un estudiante universitario, doctorando o joven postdoc, te interesan nuestras actividades de investigación y tienes ganas de desarrollar un proyecto original, no dudes en contactarnos para una estancia, una posible oferta abierta en el laboratorio o para preparar un proyecto conjunto a una agencia de financiación.
Marzo 2023: Nueva expedición DEEM a los fascinantes salares y fuentes termales del altiplano chileno. Ecosistemas microbianos únicos y gravemente amenazados por la extracción del litio en nombre de la energía "verde" (?)
2023 - Hace un año que DEEM se incorporó al nuevo edificio IDEEV en la meseta de Saclay, una extensión de la universidad Paris-Saclay - un largo periodo de adaptación antes de ser completamente funcionales
Primavera 2023: Bienvenida a Bledina Dede como nueva postdoc del equipo!
Dirección: Equipo DEEM - Unité d’Ecologie, Systématique et Evolution Site IDEEV 12 rue 128, 91190 Gif-sur-Yvette, France Teléfono: +33 (0)1 69 15 76 08
